المخطوط أو المفقود، مع الإشارة إلى موضوعات بعضها إن رأيت الحاجة داعية لذلك، ورتبتها حسب حروف الهجاء، وهي على ما يلي:
* أولا: آثاره المطبوعة:
١ - «الأجوبة الفاخرة عن الأسئلة الفاجرة»: وهو رد على أسئلة لليهود والنصارى أثاروها طعنا في الإسلام والقرآن، قام بتحقيقه د. ناجي محمد داود بجامعة أم القرى، رسالة دكتوراه في العقيدة عام ١٤٠٤ هـ، وقد حقق قبله الباحث سالم بن محمد القرني الباب الأول والثاني من الكتاب في رسالة ماجستير بجامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية - كلية أصول الدين - سنة ١٤٠٤ هـ، والكتاب مطبوع بتحقيق مجدي محمد الشهاوي بالقاهرة، وله طبعات تجارية.
٢ - «الاحتمالات المرجوحة»: رسالة في نفي القطعية عن الأدلة اللفظية الشرعية، مستفادة من القانون الكلي المقرر في المحصول للرازي، إلا أن القرافي تناولها بالشرح والتمثيل، طبعت في دار ابن حزم ١٤٢٦ هـ ضمن مجموع بعنوان «من خزانة المذهب المالكي» بتحقق الباحث: جلال علي الجهاني، وطبع في المكتبة الأثرية/ الأردن ١٤٣٣ هـ بعنوان «رسالة في تعارض الاحتمالات العشرة المخلة بالفهم في التخاطب المذكورة في كتاب المحصول من علم الأصول» بتحقيق د. أشرف بن محمود الكناني، كلاهما على نسخة وحيدة.
٣ - «الإحكام في تمييز الفتاوى عن الأحكام وتصرفات القاضي والإمام»(١)، أو «الإحكام في الفرق بين الفتاوى والأحكام»(٢): وهو كتاب في بيان الفرق بين الفتيا من المجتهد، والحكم من القاضي، وتصرفات الإمام أي وجه