الفصل الثاني: دراسة كتاب "الطرق الحكمية"، وتشمل سبعة مباحث: المبحث الأول: تحقيق اسم الكتاب، وتوثيق نسبته للمؤلف. المبحث الثاني: موضوعه، وسبب تأليفه. المبحث الثالث: منهج المؤلف في كتابه. المبحث الرابع: مصادره. المبحث الخامس: خصائص الكتاب ومزاياه. المبحث السادس: مختصرات الكتاب. المبحث السابع: وصف النسخ الخطية، ويتضمن: عدد النسخ المخطوطة، والتعريف بالنسخ، وتاريخ النسخ، ونماذج من المخطوطات.
ثانيًا: القسم التحقيقي: وقد اتبعت فيه المنهج الآتي: ١ - نسخ الكتاب وفق المخطوطات المتوفرة، بحيث يصبح أقرب ما يكون إلى الأصل الذي وضعه مؤلفه، مع إبراز الفروق بين النسخ في الهامش، وتعليل الاختيار عند الحاجة. ٢ - كتابة النص وفق القواعد الإملائية عدا الآيات فوفق الرسم العثماني. ٣ - عزو الآيات إلى مواضعها في كتاب الله تعالى.